1. Oligo(dT)
2. 隨機引物
3. 基因特異性引物
PART 02
逆轉(zhuǎn)錄引物優(yōu)劣勢比較
引物類型 | 結(jié)合部位 | 優(yōu)點 | 缺點 |
Oligo(dT) | 真核生物mRNA3’端poly(A)尾 | 可合成全長cDNA | 1、僅擴增有polyA尾的mRNA 2、對模板質(zhì)量要求高 |
隨機引物 | RNA的許多隨機可結(jié)合部位 | 適合復(fù)雜結(jié)構(gòu)和微量模板 | 特異性低,小片段多 |
基因特異性引物 | 特異性互補序列 | 特異性強,靈敏度高 | 僅合成特定的序列 |
PART 03
逆轉(zhuǎn)錄引物的選擇
RNA類型:
1、真核生物mRNA
2、miRNA、核糖體RNA和tRNA等小RNA前體加A尾處理后的模板
Oligo(dT)
1、真核生物mRNA含有poly(A)尾,可以O(shè)ligo(dT)引物結(jié)合
2、miRNA、rRNA和tRNA本身無A尾,故需要人工處理后才能與Oligo(dT)引物結(jié)合
RNA類型:
1、rRNA、tRNA、原核生物mRNA等無3’端poly(A)尾的模板
2、長度比較長、有二級結(jié)構(gòu)存在及微量樣本的模板
隨機引物
隨機引物可以在任意位點和RNA結(jié)合并開始反轉(zhuǎn)
RNA類型:
1、已知基因序列的模板
2、miRNA增加莖環(huán)結(jié)構(gòu)的模板
基因特異性引物
1、針對特定序列設(shè)計的反轉(zhuǎn)錄引物
2、miRNA(莖環(huán)法)的反轉(zhuǎn)錄,需要根據(jù)基因序列設(shè)計對應(yīng)的引物
【注】:為提高反轉(zhuǎn)錄效率,并保障獲得更加完整的cDNA,建議將Oligo(dT)和隨機引物混合使用。
PART 04
精品推薦
RNA類型 | 引物選擇 | 原因 |
1、真核生物mRNA 2、miRNA、核糖體RNA和tRNA等小RNA前體加A尾處理后的模板 | Oligo(dT) | 1、真核生物mRNA含有poly(A)尾,可以O(shè)ligo(dT)引物結(jié)合 2、miRNA、rRNA和tRNA本身無A尾,故需要人工處理后才能與Oligo(dT)引物結(jié)合 |
1、rRNA、tRNA、原核生物mRNA等無3’端poly(A)尾的模板 2、長度比較長、有二級結(jié)構(gòu)存在及微量樣本的模板 | 隨機引物 | 隨機引物可以在任意位點和RNA結(jié)合并開始反轉(zhuǎn)。 |
1、已知基因序列的模板 2、miRNA增加莖環(huán)結(jié)構(gòu)的模板 | 基因特異性引物 | 1、針對特定序列設(shè)計的反轉(zhuǎn)錄引物 2、miRNA(莖環(huán)法)的反轉(zhuǎn)錄,需要根據(jù)基因序列設(shè)計對應(yīng)的引物 |